以 18S rDNA V4区为目标基因,采用Illumina Miseq高通量测序技术,对深圳湾 2019年冬季—2021年春季 4个季节海水中浮游植物群落结构进行研究,并整理该海域有害藻华生物的历史纪录数据,以探讨深圳湾有毒有害浮游植物的群落组成及演替规律.高通量测序结果显示,深圳湾海域真核浮游植物含硅藻、甲藻、绿藻、褐藻、定鞭藻、隐藻和红藻 7 个类群,共 82科 269种.其中以微微型浮游植物为主要类群,春季和秋季以微拟球藻(Nannochloris sp.)为优势种,夏季以球等鞭金藻(Isochrysis galbana)为优势种,冬季以极小海链藻(Thalassiosira minima)为优势种.冬季浮游植物多样性指数为全年最高.此次调查共检测出有毒有害浮游植物 32种,其中甲藻 15种、硅藻 13种、褐藻 3种、定鞭藻 1种.与历史资料相比,深圳湾海域的有毒有害浮游植物呈微型化和多样性逐渐增加的趋势,呈现由甲藻或硅藻为主的有毒有害单类群群落演替到以甲藻和硅藻为主的有毒有害双类群群落的趋势.