长江刀鲚(Coilia ectenes)是我国重要的经济鱼类，目前其自然种质资源急剧衰退，探究其脂肪酸结合蛋白7(C. ectenes fatty acid-binding proteins 7, CeFABP7)基因连锁SNP位点与其生长性状的相关性，对于其生长性状的遗传改良及新品种的培育具有重要作用。本研究基于长江刀鲚的转录组数据，利用基因克隆技术获取CeFABP7基因的cDNA全长序列和基因组DNA序列，对其核心选育F_3代群体的20个具有极端生长表型个体的CeFABP7基因全长序列直接测序，筛选获得该基因上的SNP位点后，再利用直接测序法或SnaPshot法对同批次随机选取的100尾长江刀鲚进行基因分型，最后通过最小二乘法分析基因多态性与长江刀鲚生长性状的相关性。结果显示，该基因cDNA全长1 295 bp,ORF由399个核苷酸组成，编码132个氨基酸；基因组DNA全长1 899 bp，包括4个外显子和3个内含子；共检测到5个SNP突变位点和1个TGT插入/缺失突变(I/D)，分布于5'-非编码区、第1内含子和第3内含子；位点g.276C>G与长江刀鲚的体长、体高和体质量性状均显著相关(P<0.05)，位点g.306A>C、g.747C>T和g.825C>T与长江刀鲚的体质量和体高性状显著相关(P<0.05)，位点g.1447A>T和g.1532I>D由于部分基因型个体数量较少，显示与生长性状的相关性不显著；6个位点对长江刀鲚养殖群体遗传分析显示，长江刀鲚养殖群体的平均观测杂合度(observed heterozygosity, Ho)、平均期望杂合度(expected heterozygosity, He)和平均多态信息含量(polymorphic information of content, PIC)分别为0.257、0.339和0.275。长江刀鲚FABP7基因上的位点g.276C>G有望成为剔除劣质长江刀鲚繁育亲本的重要候选分子标记，本研究对长江刀鲚的分子标记辅助育种具有理论指导意义。